В самом сердце филиппинских джунглей, где влажный воздух гудит от цикад, разворачивается судьба простого солдата. Джо Армстронг, восемнадцатилетний рядовой, выполняет рутинное задание по сопровождению военного конвоя, даже не подозревая, что эта поездка навсегда изменит его жизнь. Нападение безжалостных бандитов обрушивается на отряд как удар тайфуна, и в самой гуще хаоса Джо сталкивается с чем-то необъяснимым - одним из нападающих оказывается загадочный черный воин, чьи движения слишком быстры и смертоносны, чтобы быть обычными. Это ниндзя, призрак из другого мира, внезапно материализовавшийся посреди тропического ада. И когда инстинкты берут верх, Джо с ужасом и изумлением обнаруживает, что его собственное тело отвечает на угрозу тем же древним языком боя - техникой ниндзюцу, о которой он не помнит, чтобы когда-либо учился.

Эта спонтанно проявившаяся, почти мистическая способность моментально превращает Джо из рядового солдата в объект глубокого подозрения. Его командир и сослуживцы, только что бывшие товарищами по оружию, теперь смотрят на него с недоверием и страхом, видя в нем необъяснимую угрозу. Оказавшись в ловушке между молотом вражеских наемников и наковальней недоверия собственной армии, Джо вынужден в одиночку начать расследование. Ему предстоит распутать клубок интриг, уходящий корнями в темное прошлое, полное забытых тайн. Его путь - это путь воина-одиночки, вынужденного сражаться не только с видимым врагом, но и с тенью коррупции, проникшей в самые, казалось бы, надежные структуры. "Американский ниндзя" - это история о пробуждении силы, которую нельзя скрыть, и о единственной битве, которую невозможно избежать - битве за правду и собственное предназначение.