Приближаясь к финалу своего седьмого воплощения, Доктор предстает перед судом Повелителей Времени. Ему инкриминируют тяжкое преступление - незаконную транспортировку останков его заклятого товарища и противника, известного как Мастер, обратно на родную планету Галлифрей. Несмотря на все ритуалы и предосторожности, древнее зло оказалось куда более живучим, чем кто-либо мог предположить. Мастер не просто выжил - он вернулся, исполненный новой, изощренной мести, которая ставит под угрозу не только жизнь Доктора, но и ход земной истории.

Коварный план Мастера приводит к катастрофической поломке в сердце ТАРДИС - ее хрональной системе. В результате временной вихрь забрасывает непримиримых соперников в Сан-Франциско на пороге нового тысячелетия, в 1999 год. Используя хаос и технологические возможности конца века, Мастер совершает побег, чтобы осуществить свой последний замысел. Теперь Доктору, чьи силы на исходе, предстоит гонка против времени в буквальном смысле: он должен отыскать сверхточные атомные часы, ключевой элемент в опасной схеме его бессмертного врага, и предотвратить катастрофу, способную навсегда изменить лицо человечества.