Два года спустя после событий с "Возмездием" звездолет "Энтерпрайз" под командованием капитана Джеймса Тибери Кирка вновь бороздит космические просторы, выполняя свою главную миссию - искать новые миры и цивилизации. Однако рутина исследовательской экспедиции обрывается в одно мгновение, когда на корабль обрушивается яростная и необъяснимая атака. Таинственный противник, отказывающийся от любых переговоров, обрушивает на "Энтерпрайз" всю свою мощь, и Кирк с ужасом осознает, что его легендарный корабль не переживет этого столкновения. Единственный шанс для экипажа - срочная эвакуация на ближайшую неизведанную планету.

Оказавшись на чужой и враждебной земле, команда пытается собраться с силами, но преследование продолжается. Становится ясно, что эта агрессия - не случайность и не следствие нарушения границ, а целенаправленная охота, движимая глубокой личной ненавистью к самой Федерации. В этот отчаянный момент к героям неожиданно приходит помощь в лице воительницы Джайлы. Именно она знает, что стоит за этим беспощадным нападением, и может назвать имя того, кто ведет охоту - Кролл. Чтобы выжить и найти способ противостоять могущественному врагу, Кирку и его команде предстоит объединиться с новой союзницей и раскрыть темные тайны, которые превратили мирную миссию в борьбу за существование.