В Карпантру, охваченную суеверным ужасом, прибывает великий инквизитор Барналь. Поручение папы Климента VII звучит как приговор тишине: в городе совершено неслыханное дьявольское преступление. Найден священник, распятый на кресте прямо перед порталом своей же церкви, и это зловещее знамение грозит ввергнуть весь регион в пучину религиозной истерии и кровавого мщения. Барналь, человек логики и холодного рассудка в эпоху фанатизма, должен докопаться до истины, которая, как он чувствует, скрыта глубоко под слоями страха и предрассудков.

Параллельно этой официальной миссии в еврейском квартале разворачивается своя драма. Врачи Давид и его сын Самюэль, рискуя свободой и жизнью, нарушают строжайший запрет, чтобы спасти в тяжелейших родах жену и ребенка простого горожанина Лекло. Этот акт милосердия, совершенный вопреки всем законам и барьерам, становится для Самюэля роковым. Едва он выходит из дома, где дарил жизнь, как его взору открывается новое чудовищное зрелище: на кресте соседней церкви пылает живым факелом аббат Тюйяр. Теперь тень подозрения, отбрасываемая пламенем этого кошмарного ритуала, ложится прямо на него, превращая спасителя в главного подозреваемого в глазах охваченной паникой толпы.

Две линии - расследования инквизитора и судьбы врача - стремительно сходятся, затягивая в смертельный водоворот. Барналь вынужден искать правду не только среди церковных интриг и народных слухов, но и в мире, отгороженном стеной непонимания - мире еврейской общины, живущей по своим законам. Фильм погружает зрителя в мрачную и душную атмосферу Франции XVI века, где наука борется с суеверием, милосердие - с догмой, а поиск истины может стоить жизни не только тому, кто ищет, но и тем, кого он пытается защитить. Это история о том, как один акт человечности становится искрой, способной разжечь костер нетерпимости, и о том, может ли один разумный человек остановить надвигающуюся бурю.