Четыре черепашки по имени Леонардо, Рафаэль, Микеланджело и Донателло – ниндзя, готовые стать американскими героями. Под руководством опытного учителя, крысы Сплинтера, они сражаются с представителями криминального мира Нью-Йорка. Многомиллионный мегаполис погрузился в пучину преступного хаоса, и только бесстрашные бойцы способны противостоять бандитам. Безумный Шредер создает клан Футов, в который вступают опаснейшие безжалостные убийцы и головорезы. Все местные полицейские участки давно подчиняются негодяю, и раскрывать преступления некому. Горожанам необходима защита, невинные люди страдают от нападений негодяев.

Четверо ниндзя отважно бросаются на борьбу с врагами. С помощью бесстрашного репортера, девушки Эйприл, братья борются за торжество справедливости и стараются восстановить правопорядок. Саркастичный оператор Верн Фенвик охотно помогает главным героям в их нелегком деле. Необходимо разгадать дьявольский план Шредера, чтобы спасти жителей города от неприятностей. Мудрый наставник раскрывает секреты мастерства, чтобы воины в совершенстве освоили боевые искусства и смогли освободить город от могущественного злодея.